
2024年9月由杭州畜牧业本科大学张万刚博士生导师精英团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物学为该研究提供了亚硝基化掩盖组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
汉语版头:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
论文期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2023年不良影响成分:5.7
投稿的时间:2024年9月
雇主计量单位:南京农业大学
探析物料:蛋白
拜谱展示 技术性:亚硝基化修饰组学
技术设备交通路线:
一、设计但是
01.Caspase-3活性酶类
近几年尚不非常清楚NO对caspase-3的治理和改善效用是不是也归因于NO介导的S-亚硝基化,不一样的溶液浓度均值的GSNO是外源性NO生产商,以引诱caspase-3的休外S-亚硝基化。效果反映,与不会有GSNO的组对比,100、200和400μM GSNO组的caspase-3生物不错下降(图1),与已经新闻不一。GSNO处里下降caspase-3生物的因素的原因仍亟需具体分析。
图1 有所不同氨水浓度的GSNO工作对caspase-3灵活性的影晌
02.Caspase-3的S-亚硝基化成度
论述Caspase-3的亚硝基化方面,以确立GSNO对Caspase-3的作用性。经GSNO正确处理后,测试到caspase-3蛋清S-亚硝基化抗拉强度扩大(图2)。以下数据体现了,外源性GSNO培养教育可顺利分析caspase-3的休外S-亚硝基化。令人感动惊艳的是,在不现实存在GSNO现实存在的比对组中测试到是一个较弱的S-亚硝基化带,这体现了caspase-3可能性形成内源性的S-亚硝基化。除外,本论述中caspase-3的S-亚硝基化方面较高,而caspase-3的活性酶降低了,这与事先的论述同步。虽然,caspase-3的炎症因子聊天S-亚硝基化体现位点尚不非常清楚,还要求进一大步的不断探索。
图2 GSNO操作对caspase-3S-亚硝基化标准的会影响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化修饰语组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。蓝色系标识的字段透露S-亚硝基化肽,红颜色标识的C透露S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3吸附结蛋白酶
结血清看作另一种重点性的肿瘤癌细胞骨架血清,在形成肌肿瘤癌细胞成分的成分完正性和收缩毛孔性工作方面起重在要性寓意,探析S-亚硝基化caspase-3对结血清生物化学降解的皮肤敏情绪化兼有重点性寓意。与Std(未用胱天血清酶-3和GSNO孵育的初始状态肌氯纶血清)组比较,0 μM GSNO组(肌原氯纶和caspase-3的孵育,无GSNO)的完正结血清含水量不错缩减,的提示caspase-3对结血清兼有潜在性的血清油脂水解力量。在GSNO孵育后,完正结血清的含水量凸显不断增加(P < 0.05)。凡此种种,当GSNO溶度身高时,完正结血清的含水量连续上浮(P < 0.05)(图5)。上述察觉阐明,SNO遮盖的caspase-3以能力依赖感的方试可以抑制结血清的生物化学降解。
图5.S-亚硝基化caspase-3分解结核蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3化学降解肌钙蛋清-T
肌钙球球球淀粉酶-T (TnT)是原肌球球球球淀粉酶上下调整进行肌肤缩小的细细的的必须肌原钎维球球球淀粉酶。TnT的分解特殊性是检查测量到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化因素下,caspase-3对TnT的分解原因随时6随时,与Std组(不含有caspase-3和GSNO的肌原钎维)不同之处,caspase-3组中30 kDa TnT精彩场面为强势加大,表面caspase-3参予了TnT的分解,不仅,caspase-3与GSNO的孵育造成的30 kDa TnT变低。在100和200 μM GSNO组两者无检查测量到强势的的异同(P > 0.05),而当GSNO的含量达到了400 μM 时,该精彩场面为强势变少(P < 0.05)。他们显示表面了SNO掩盖的caspase-3对TnT分解的可抑设计制业务能力。结球球球淀粉酶和TnT是caspase-3的灵敏底物,而GSNO外理调低caspase-3的特异性酶会造成的肌原钎维球球球淀粉酶分解状态调低。上述讲到所说,NO诱骗的S-亚硝基化能否能够 掩盖半胱氨酸残基来上下调整caspase-3的特异性酶,必将进一次引响其对结球球球淀粉酶和TnT的球球球淀粉酶水解反应业务能力,于是引响牛羊肉产品品质。
图6. S-亚硝基化caspase- 3可降解肌钙核蛋白-T
二、个人总结
本调查主要是浅谈S-亚硝基化对caspase-3呈现的危害试述后来对牛羊肉肌原植物纤维素身体之外生物降解的危害。蛋清S-亚硝基化能够 呈现caspase-3的半胱氨酸残基,得以造成的caspase-3活性酶减少,进1步抑止了其对牛羊肉肌原植物纤维素蛋清的蛋清淀粉水解技能。三、拜谱个人总结
分析一下采用了了酶活测得,亚硝基化遮盖组学分析一下,WB等监测方式方法,发掘蛋清S-亚硝基化可不可以遮盖caspase-3的半胱氨酸残基,这造成 了caspase-3化学活化的下降,相结一步一个脚印阻止了其对羊肉肌原玻璃纤维蛋清的蛋清淀粉水解工作能力。本分析一下为解说蛋清质亚硝基化对吃起来的调空策略供给新一个新的视域。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的氨基酸酶质组学、掩盖氨基酸酶质组学、分解代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系类产品的,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total空气氧化呈现、游离子巯基,欢迎大家咨询!
参考价值文献综述:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663