
近日,南京市医科一本大学第1所属医院专家王学浩科学院院士精英团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向治疗热量细胞代谢检测分析服务。
英语怎么说文章标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
2英文宝贝标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
业主的单位:南京医科大学
实验物料:细胞
拜谱展示 安全服务:转录组测序+血清互作组+靶向药物体力产生组
技术工艺路经:
探讨成果
01、YBX1被鉴定会为HCC中糖酵解的重要性什么是基因
本深入定量探讨爬取HCC癌肿模板(n=7)的单公司神经体细胞RNA测序数剧资料集来确定定量探讨,发现糖酵解活性酶类主要集结在癌肿公司神经体细胞中,hdWGCNA定量探讨判断出9个遗传基因信息模块(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的存在定量探讨来确定YBX1为单独的存在危害性问题(图1H)。进一部依照IHC、WB检测和癌肿公司与领近非癌肿公司的个人空间转录组学数剧资料集查证YBX1是肝公司神经体细胞癌治療的隐藏的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被选择为改善HCC组织细胞糖酵解的关键影响因素影响因素
02、YBX1有助于HCC中的有氧糖酵解和增值能力
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点养分排泄组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1带动HCC中的有氧糖酵解和繁衍
03、OGT与YBX1通过并促使YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1通过并可以淡化YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化怎强其磷硝化作用,所以促进会其核转位
进三步监测YBX1的O-GlcNAc糖基化可不可以后果其磷碱化,在OGT敲低的HCC細胞中或用OGT仰溶液剂OSMI-1办理,YBX1球血清标准为正相关削减,YBX1磷碱化为正相关限制(图4A-C)。IP实验所显视,在重复的Flag-YBX1底物标准下,YBX1-WT的磷碱化标准为正相关少于YBX1-T57A,显示磷碱化的改善不光仅是正由于更多的YBX1球血清表达出来出(图4D)。破乳了核和质多组分察觉到TMG办理的HCC細胞中YBX1核表达出来出的上升(图4E-F),进三步察觉到YBX1磷碱化的核心调准要素是AKT(图4G-I)。这部分察觉到反复强调O-GlcNAc糖基化顺利通过加速其磷碱化来改善YBX1球血清维持性并加速核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 遮盖优势于其更深层次的一个脚印有磷过酸遮盖并要能有助于其核转位
05、YBX1使得PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1推进PKM2转录
06、YBX1 才可以提生组核蛋白乳碱化表达含量
钻研会发现YBX1敲低特殊拉低蛋清质乳碱化,越发是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解阻止剂2-DG的测试确认了糖酵解与组蛋清乳碱化的立即相关联,阻止糖酵解可特殊拉低H3K18la含量(图6D)。PKM2过表述可逆性转YBX1敲低导致的的H3K18la的降低,之外源乳酸治疗仅仅提拔H3K18la,还跟随YBX1表述调整,建议具备正面信息反馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR确认,H3K18la凭借聚集于YBX1开启子立即带动其转录,该操作过程受O-GlcNAc糖基化管控(图6H-J),并会发现P300 调整是YBX1促进H3K18乳酰化做用的体系(图6K-L)。
图6.YBX1怎强H3K18乳酸性反应淡化平行
好文章总结ppt
在仅仅学习中通讯稿了YBX1在HCC中高抒发,最后与糖酵解迷切想关内容。YBX1在T57处被O-GlcNAc绘制语,最后安稳蛋白质酶质并增高其抒发。这样的绘制语还提升YBX1在T57处的磷酸性反应,提升其核易位。由此,这一种的时候提升了糖酵解想关内容什么是基因组的转录并伤害性乳酸的出现。凡此种种,YBX1激发P300的转录,以致控制组蛋白质酶的乳酸性反应,有点是H3K18la,H3K18乳酸性反应双向干预YBX1什么是基因组转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因遗传正反两面馈环策略图
拜谱个人总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物制品为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶点能量转换分解代谢组技术服务,拜谱生态学建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、讲述后体现组学、新陈代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
符合医学文献
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.