草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿整体性通常见到的重大疾病在这其中之一。肾组织结构中CaOx晶胞过趋于稳定基性岩会影响肾小管癌细胞问题和凋亡，于是影响肾结石的达成。短链皮下脂肪细胞酸由肠子内好氧菌大肠杆菌沤肥饮食营养棉纤维所产生，不仅仅在部分区域肠子第一道防线中引领功效功效，但是在整体性横向上也引领功效最为关键的功效。在这其中，丁酸是最丰富的的短链皮下脂肪细胞酸，具有着抗感染和免疫抗体遏制功效,本设计试论丁酸对CaOx肾结石的功效和其潜在性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院专家泌尿普外吴忠先生、周子健医学博士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠讲师、周子健博士研究生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱动物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了手机网络药理学学服务的，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

短文名字大全：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 消费者部门：华山医院口腔科 研究探讨对象图片：大鼠、HK-2细胞核 排列信息：较组（Con）、建模组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱能提供技术工艺：网格药学学检则

想法具体步骤图

设计結果

深入分析成员先是勾勒大鼠绘图，利用女性生理什么是生化公式和组识病理学学染料等深入分析科技手段挖掘丁酸就可以控制CaOx绘图大鼠肾CaOx纳米线的演变成和挫伤，调节CaOx绘图大鼠的宫颈炎症挫伤和空气脱色元素的过度紧张表述。最后，丁酸还可控制草酸促进的HK-2体肿瘤细胞挫伤、空气脱色应激状态和体肿瘤细胞凋亡。 为来探寻丁酸框架和靶什么是表观遗传组系统，设计人员管理从PubChem添加丁酸和丁酸酯的二维和3D框架（图1A）。能够 PharmMapper数值信息库和Uniprot数值信息库处里后共需求出1115个丁酸靶什么是表观遗传组供下一步一个脚印了解。将什么是表观遗传组下拉列表导成STRING数值信息库，确定PPI系统了解。Cytoscape说出了排名的前20的核心靶什么是表观遗传组的详细反映系统图，还包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这种核心什么是表观遗传组与系统中的某些什么是表观遗传组均展示出固定的关于内容性，反映这种什么是表观遗传组概率充分利用用着分工协效用。GO和KEGG了解呈现了丁酸核心什么是表观遗传组的关于内容方式和微生物技术学功能性（图1C）。核心什么是表观遗传组最常见与类固醇缴素药初次对答、空气空气氧化应激状态状态初次对答、可溶性氧体细胞对类固醇缴素药刺激到的影响还有对偏酸普通机械有机化合物的影响有观。上面所讲，这种核心什么是表观遗传组最常见参与到了空气空气氧化应激状态状态和对可溶性氧的微生物技术影响整个过程，是肾结石产生共识机制中至关极为至关重要的方式，这得出结论丁酸概率在肾结石中充分利用用极为至关重要用。

图1| 丁酸结构特征与靶染色体系统概述(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一个步骤探索世界丁酸对CaOx肾结石确确实实切靶DNA，探讨专业有关职工回收利用GEO资料库对GSE73680中安全对应与CaOx肾结石自身的DNA不同之处做出了探讨。对应组与CaOx结石自身的有效性不同之处体现DNA（DEGs）挑选细则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个DNA情况有效波动，这当中3379个（89.4%）DNA体现调涨，404个（10.6%）DNA体现下跌（图2A）。对DEGs做出聚类算法介绍介绍，热图出现了前10个被选中DEGs的二维层次结构聚类算法介绍特征描述（图2B）。那么，探讨专业有关职工凭借GeneCards资料库人工服务检测了370个可以与CaOx肾结石有关的DNA，排榜前20位的预測DNA极其有关性评判下图2C右图。为了能寻找丁酸治愈CaOx肾结石的重要靶点，探讨专业有关职工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关DNA工作能够 新一个Venn图。然后，CYP2C9被设定为丁酸危害CaOx肾结石的潜在性的靶点(图2D)。于此，探讨专业有关职工还做出了丁酸与CYP2C9的分子结构合作，CYP2C9的三种蛋白质残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸完美的功效，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在回收利用系统药剂学学预测分析CYP2C9是丁酸影响到CaOx肾结石的靶染色体后，探析人士还能够 生殖细胞系实验所表明了CYP2C9可下降草酸诱发的HK-2生殖细胞系的ROS关卡、感染破损和凋亡。

图2| 很多据库联席了解预计CYP2C9是丁酸功用于CaOx肾结石的靶染色体

研发结杲

本理论研究第一方面出现 丁酸在身体和身体内部均能压制CaOx肾结石建模的阳极氧化反应应激性性和细菌感染伤到，接着实现wifi网络上药学学筛分取得丁酸作用CaOx肾结石的潜在的靶点——CYP2C9，最后一个实现神经元实验操作得知CYP2C9在草酸盐诱导型的HK-2神经元ROS水平面、细菌感染伤到和凋亡。这样的出现 证实丁酸可能性实现压制CYP2C9来压制CaOx肾结石的阳极氧化反应应激性性，减少细菌感染伤到。上述操作过程中拜谱动物出示了wifi网络上药学学能力应用功能，不但拜谱动物可提供发育成熟健全完善的dna组学、核膳食纤维组学、分泌组学等几组学车辆及能力应用功能，欢迎语致电的方式质询！ 参照论文毕业论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.