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首页 > 拜谱生物 > 市场活动 > 品牌公布的|乳酸性反应的逆袭之亲兄弟,衣康酸性反应呈现蛋白质组高冷肆虐!

新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

向来为化工公司原辅材料而被掌握的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“分解废料”拥有“宝藏地方小分子式”的艰辛经历是类似的,终究会近10半年才被感觉其极为重要的生物学功能表,从“翻盘农奴把唱歌”,十分是在天然免疫支原体感染性患病科研方面内与时共进。已经数篇参考文献新闻了在各式各样支原体感染性患病的节肢动物型号中给与衣康酸或其化学反应淡化衍生品物的诊治益处,并感觉其存在靶点。关羽衣康酸的“上辈子”与“今身”,详细推书《乳酸的逆袭吧把兄弟——衣康酸!文中与你知晓衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应装饰血清组学产品,实现1000+深奥度淡化位点排除,平稳初现有趣靶点,全位置生信分析一下解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看到”到“校验”全环节服务性,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、试验方案

02、测量数据信息

03、经“点”再次出现

在测试信息信息中,验出两个医学文献中新闻报道的经典传奇靶点名词解释衣康酸体现位点,如第一家个被感觉的衣康酸共价体现蛋白质酶酶KEAP1,也有糖酵解信号通路中的3个主要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,或炎性小体組成蛋白质酶酶NLRP3和癌细胞损伤阶段中的主要蛋白质酶酶RIPK3等,其质谱图一下图如下图所示。

04、物品显著特点

1.多大质控

餐饮业化特喜欢的人探头孵育、SDS-PAGE检查测量、WB认可、样表一些性剖析等各种位检查测量,狠抓項目数据靠得住性。

2.高能力质谱检测设备公司

在Orbitrap Astral全新新一批高判别质谱仪金刚萨垛下,满足衣康酸性反应掩盖位点及淀粉酶签别新深入,促动完美的研究新知道。

3.全方法一趟式服务管理

为拜谱生物体改善的调查电商平台,可展示“细胞膜锻炼→探头孵育→WB在线检侧→玄妙度衣康硝化作用修饰语在线检侧→专用生信定性分析→单一位点PRM证实”全标准流程服务性,省时贴心更贴心。

05、分析一下东西(的部分)

06、用途中心点

PART 2、文献资料分亨

资料一

英语大标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

常常微信标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

探究内部:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

文章二

国外英文副标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

常常文章标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

研究方案玩法:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、拜谱生物随之出现难点

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备着强大的底物相结合程度,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物技术衣康过酸遮盖组评测资料中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用装饰(正确图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱工作小结

看作TCA再循环中的前面细胞新陈新陈代谢物,衣康酸调低细胞新陈新陈代谢、免疫力系统力和细菌感染两者的相护的功效,为调理免疫力系统力细菌感染性问题给出了用作调理策略性。衣康酸框架的中的亲电性α,β-不饱和状态羧酸框架的能对血清质上的抗逆性半胱氨酸残基进行烷基化突显(迈克尔加持生理反应),一项泰语翻译后突显被称作“衣康酸突显(itaconation)”,而能影响到血清质功能键,国家宏观调控免疫力系统力对答和细胞新陈新陈代谢方法,为几种问题药研制给出新指导思想。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用呈现核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物临床医学完全酶联免疫法靶点基础代谢组(QMT1000)或电量分解靶向药物分解组类产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参考使用论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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